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This research was supported by the Instituto Nacional de Investigacion y Tecnologia Agraria y Alimentaria (INIA) (grants RTA2012-00097, RTA2015-00046, and RFP2015-00015) and the Gobierno de Aragon- European Social Fund, European Union (Grupo Consolidado A12).

Análisis de autorías institucional

Pina, AAutor (correspondencia)Irisarri, PAutor o CoautorErrea, PAutor o Coautor

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12 de abril de 2021
Publicaciones
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Artículo

Mapping Quantitative Trait Loci Associated With Graft (In)Compatibility in Apricot (Prunus armeniaca L.)

Publicado en:Frontiers In Plant Science. 12 (622906): 622906- - 2021-02-19 12(622906), DOI: 10.3389/fpls.2021.622906

Autores: Pina, Ana; Irisarri, Patricia; Errea, Pilar; Zhebentyayeva, Tetyana

Afiliaciones

Ctr Invest & Tecnol Agroalimentaria Aragon CITA, Unidad Hortofruticultura, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
Penn State Univ, Dept Ecosyst Sci & Management, Schatz Ctr Tree Mol Genet, University Pk, PA 16802 USA - Autor o Coautor
Univ Zaragoza, CITA, Inst Agroalimentario Aragon IA2, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor

Resumen

Graft incompatibility (GI) between the most popular Prunus rootstocks and apricot cultivars is one of the major problems for rootstock usage and improvement. Failure in producing long-leaving healthy grafts greatly affects the range of available Prunus rootstocks for apricot cultivation. Despite recent advances related to the molecular mechanisms of a graft-union formation between rootstock and scion, information on genetic control of this trait in woody plants is essentially missing because of a lack of hybrid crosses, segregating for the trait. In this study, we have employed the next-generation sequencing technology to generate the single-nucleotide polymorphism (SNP) markers and construct parental linkage maps for an apricot F-1 population Moniqui (Mo) x Paviot (Pa) segregating for ability to form successful grafts with universal Prunus rootstock Marianna 2624. To localize genomic regions associated with this trait, we genotyped 138 individuals from the Mo x Pa cross and constructed medium-saturated genetic maps. The female Mo and male Pa maps were composed of 557 and 501 SNPs and organized in eight linkage groups that covered 780.2 and 690.4 cM of genetic distance, respectively. Parental maps were aligned to the Prunus persica v2.0 genome and revealed a high colinearity with the Prunus reference map. Two-year phenotypic data for characters associated with unsuccessful grafting such as necrotic line (NL), bark and wood discontinuities (BD and WD), and an overall estimate of graft (in)compatibility (GI) were collected for mapping quantitative trait loci (QTLs) on both parental maps. On the map of the graft-compatible parent Pa, two genomic regions on LG5 (44.9-60.8 cM) and LG8 (33.2-39.2 cM) were associated with graft (in)compatibility characters at different significance level, depending on phenotypic dataset. Of these, the LG8 QTL interval was most consistent between the years and supported by two significant and two putative QTLs. To our best knowledge, this is the first report on QTLs for graft (in)compatibility in woody plants. Results of this work will provide a valuable genomic resource for apricot breeding programs and facilitate future efforts focused on candidate genes discovery for graft (in)compatibility in apricot and other Prunus species.

Palabras clave

apricotbreedinggraft incompatibilitylinkage mapquantitative trait lociApricotBreedingGraft incompatibilityLinkage mapQuantitative trait lociSequence-based genotyping

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Frontiers In Plant Science debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2021, se encontraba en la posición 20/239, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.09. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.17 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 4.07 (fuente consultada: Dimensions Jul 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-07-13, el siguiente número de citas:

  • WoS: 15
  • Scopus: 16
  • Europe PMC: 7

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-13:

  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 20 (PlumX).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: United States of America.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Pina Sobrino, Ana) .

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Pina Sobrino, Ana.