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This work received funding from Ministerio de Ciencia e Innovacion/Agencia Espanola de investigacion MCIN/AEI/https:// doi. org/ 10. 13039/ 50110 00110 33 and, as appropriate, by ERDF A way of making Europe by the European Union or by the European Union NextGenerationEU/PRTR (Grant agreement PID2020-114617RB-100), from Gobierno de Aragon (Department of I + D + I projects in priority lines, Grant agreement LMP58_21), and by University of Zaragoza (Grant agreement UZ2020-BIO-01). The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.

Análisis de autorías institucional

Calvo, Jorge HugoAutor o CoautorMarin, Clara MAutor o Coautor

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15 de junio de 2024
Publicaciones
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Artículo
Sí

Genomic and phenotypic analysis of invasive Streptococcus suis isolated in Spain reveals genetic diversification and associated virulence traits

Publicado en:Veterinary Research. 55 (1): 11- - 2024-01-24 55(1), DOI: 10.1186/s13567-024-01267-0

Autores: Uruen, Cristina; Fernandez, Ana; Arnal, Jose Luis; del Pozo, Mateo; Amoribieta, Maria Casas; de Blas, Ignacio; Jurado, Paula; Calvo, Jorge Hugo; Gottschalk, Marcelo; Gonzalez-Vazquez, Luis Daniel; Arenas, Miguel; Marin, Clara M; Arenas, Jesus

Afiliaciones

ARAID, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
CINBIO, Vigo, Spain - Autor o Coautor
Ctr Res & Technol Aragon CITA, Dept Anim Sci, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
Exopol Vet Diagnost & Autogenous Vaccine Lab, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
LABOPAT NUZOA SL, Labopat, Segovia, Spain - Autor o Coautor
Ovislab, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Univ Montreal, Fac Vet Med, Poultry Infect Dis Res Ctr, St Hyacinthe, PQ, Canada - Autor o Coautor
Univ Montreal, Fac Vet Med, Res Grp Infect Dis Prod Anim & Swine, St Hyacinthe, PQ, Canada - Autor o Coautor
Univ Vigo, Dept Biochem Genet & Immunol, Vigo, Spain - Autor o Coautor
Univ Zaragoza, Fac Vet, Unit Infect Dis, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
Univ Zaragoza, Fac Vet, Unit Microbiol & Immunol, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
Univ Zaragoza, Inst Agrofood Aragon, Ctr Res & Technol Aragon CITA, IA2, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Streptococcus suis is a zoonotic pathogen that causes a major health problem in the pig production industry worldwide. Spain is one of the largest pig producers in the world. This work aimed to investigate the genetic and phenotypic features of invasive S. suis isolates recovered in Spain. A panel of 156 clinical isolates recovered from 13 Autonomous Communities, representing the major pig producers, were analysed. MLST and serotyping analysis revealed that most isolates (61.6%) were assigned to ST1 (26.3%), ST123 (18.6%), ST29 (9.6%), and ST3 (7.1%). Interestingly, 34 new STs were identified, indicating the emergence of novel genetic lineages. Serotypes 9 (27.6%) and 1 (21.8%) prevailed, followed by serotypes 7 (12.8%) and 2 (12.2%). Analysis of 13 virulence-associated genes showed significant associations between ST, serotype, virulence patterns, and clinical features, evidencing particular virulence traits associated with genetic clusters. The pangenome was generated, and the core genome was distributed in 7 Bayesian groups where each group included a variable set of over- and under-represented genes of different categories. The study provides comprehensive data and knowledge to improve the design of new vaccines, antimicrobial treatments, and bacterial typing approaches.

Palabras clave

AnimalsBayes theoremClustersDiseased pigsEpidemiologyGenetic recombinatioGenetic recombinationGenomicsIdentificationMultilocus sequence typingPcr assaySbpSpainStreptococcus suisSwineVirulenceVirulence factors

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Veterinary Research debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2024 aún no existen indicios calculados, pero en 2023, se encontraba en la posición 10/167, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Veterinary Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

2025-07-16:

  • Google Scholar: 1
  • WoS: 8
  • Scopus: 5
  • Europe PMC: 7

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-16:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 15.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 17 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 11.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 4 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: http://hdl.handle.net/10532/6846

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Canada.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Uruen, Cristina) y Último Autor (Arenas, Jesús).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Arenas, Jesús.