{rfName}
De

Indexado en

Licencia y uso

Icono OpenAccess

Citaciones

2

Altmetrics

Grant support

FEDER within the POCTEFA framework PIRINNOVI EFA103/15

Análisis de autorías institucional

Calvo J.h.Autor (correspondencia)Iguacel L.p.Autor o CoautorFolch, JoseAutor o CoautorAlabart J.l.Autor o CoautorLahoz B.Autor o Coautor

Compartir

4 de junio de 2021
Publicaciones
>
Artículo
Sí

Development of a SNP parentage assignment panel in some North-Eastern Spanish meat sheep breeds

Publicado en:Spanish Journal Of Agricultural Research. 18 (4): 1-8 - 2020-01-01 18(4), DOI: 10.5424/sjar/2020184-16805

Autores: Calvo, Jorge H; Serrano, Magdalena; Tortereau, Flavie; Sarto, Pilar; Iguacel, Laura P; Jimenez, Maria A; Folch, Jose; Alabart, Jose L; Fabre, Stephane; Lahoz, Belen

Afiliaciones

ARAID, Av Ranillas 1-D, Zaragoza 50018, Spain - Autor o Coautor
CITA IA2, Prod & Sanidad Anim, Av Montanana 930, Zaragoza 50059, Spain - Autor o Coautor
Grupo de investigación Sistemas AgroGanaderos Alimentarios Sostenibles (SAGAS). Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón - Autor o Coautor
INIA, Mejora Genet Anim, Ctra La Coruna Km 7-5, Madrid 28040, Spain - Autor o Coautor
Instituto Agroalimentario de Aragón (IA2). Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón - Autor o Coautor
Univ Toulouse, GenPhySE, INRAE, ENVT, F-31326 Castanet Tolosan, France - Autor o Coautor
Ver más

Resumen

Aim of study: To validate two existing single nucleotide polymorphism (SNP) panels for parentage assignment in sheep, and develop a cost effective genotyping system to use in some North-Eastern Spanish meat sheep populations for accurate pedigree assignment. Area of study: Spain Material and methods: Nine sheep breeds were sampled: Rasa Aragonesa (n=38), Navarra (n=39), Ansotana (n=41), Xisqueta (n=41), Churra Tensina (n=38), Maellana (39), Roya Bilbilitana (n=24), Ojinegra (n=36) and Cartera (n=39), and these animals were genotyped with the Illumina OvineSNP50 BeadChip array. Genotypes were extracted from the sets of 249 SNPs and 163 SNPs for parentage assignment designed in France and North America, respectively. Validation of a selected cost-effective genotyping panel of 158 SNPs from the French panel were performed by Kompetitive allele specific PCR (KASP). Additionally, some functional SNPs (n=15) were also genotyped. Main Results: The set of 249 SNPs for parentage assignment showed better diversity, probability of identity, and exclusion probabilities than the set of 163 SNPs. The average minor allele frequency for the set of 249, 163 and 158 SNPs were 0.41 + 0.01, 0.39 + 0.01 and 0.42 + 0.01, respectively. The parentage assignment rate was highly dependent to the percentage of putative sires genotyped. Research highlights: The described method is a cost-effective genotyping system combining the genotyping of SNPs for the parentage assignment with some functional SNPs, which was successfully used in some Spanish meat sheep breeds.

Palabras clave

Animal breedingAutochthonous breedsGenotypingGoatsIncreaseMicrosatellite markersPedigreePolymorphismsPrion protein geneScrapieSterilityVerification

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Spanish Journal Of Agricultural Research, y aunque la revista se encuentra clasificada en el cuartil Q3 (Agencia WoS (JCR)), su enfoque regional y su especialización en Agriculture, Multidisciplinary, le otorgan un reconocimiento lo suficientemente significativo en un nicho concreto del conocimiento científico a nivel internacional.

2025-10-28:

  • Google Scholar: 1
  • WoS: 1

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-10-28:

  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 6 (PlumX).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Además, el trabajo se ha enviado a una revista clasificada como Diamante en relación con este tipo de política editorial.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: France.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Calvo Lacosta, Jorge Hugo) y Último Autor (Lahoz Crespo, Belén).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Calvo Lacosta, Jorge Hugo.